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1种高效的化学衊肿臃ㄓ盏级嗄芨上赴及相关染色质动力学研究

  • 发布时间:2021-09-07
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研究亮点

1CIP发生于由无血清化学混合物和2iL介导的两个阶段.

2CIP过程中基于ATAC-seq的染色质动力学与传统的OSK重编程不同.

3CIP过程中的染色质动力学突出了GATAs .SOXsFOXs的作用.

4BrdU于染色质重建时发挥了关键作用.

 

研究摘要

    尽管具有令人兴奋的潜力但是目前化学衊肿佑盏嫉亩嗄苄裕chemical induction of pluripotencyCIP)效率仍然很低相关的机制也了解甚少.本研究开发了1种高效的两步法CIP方案该方案不含血清且无需再次接种(图1);此外通过使用高通量测序对易接近转座酶核染色质区域进行分析(ATAC-seq技术)本研究对CIP过程中的相关染色质动力学(chromatin accessibility dynamicsCADs)进行了研究(图2).CIP过程将体细胞基因组重建为中间态后于2iL(CHIR99021+PD0325901+LIF)的介导下重新关闭之前已打开的基因位点逐步打开OCT / SOX / KLF家族基序的基因位点从而获得多能性.溴脱氧尿苷(BromodeoxyuridineBrdU)是CIP过程中的关键因子它负责关闭和打开关键基因位点包括阻止富含AP1家族基序的基因位点的打开以及促进富含SOX/ KLF / GATA基序的基因位点的打开(图3).这些CAD变化明显不同于Yamanaka因子驱动的重编程.该研究将进1步加深人们对基于衊肿拥闹乇喑袒制以及与细胞命运决策相关的核结构重组机制的认识.

 

1 从小鼠胚胎成纤维细胞获得化学衊肿佑盏嫉亩嗄芨上赴

 

2 CIP过程中的染色质动力学

 

3 BrdU调控CIP过程中的染色质结构

 

参考文献:Chromatin Accessibility Dynamics during Chemical Induction of Pluripotency. Cell Stem Cell. 2018, 22: 529–542. 


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